Nace en Sevilla, ciudad en la que realiza los estudios de clarinete con Antonio García Herrera, en el CSM Manuel Castillo, finalizando los mismos con el Premio de Honor Fin de Carrera. Posteriormente amplía estudios en la Escuela Normal de Música de París, con Guy Deplus, obteniendo los diplomas superiores de clarinete y música de cámara con las máximas distinciones de dicha institución.
En 1997 obtiene el Premio Dos Hermanas, en el Concurso Internacional del mismo nombre; posteriormente será galardonado con el Segundo Premio en el Concurso Internacional de Música de Cámara “Guadamora”. Ha colaborado en numerosas ocasiones con la Real Orquesta Sinfónica de Sevilla, con la Orquesta de Córdoba y con la Orquesta Nacional de España, entre otras, así como con Solistas de Sevilla y Trío Pleyel; con este último ha grabado un Cd para el sello Lindoro y varias grabaciones para RNE.
En 2005 participa en la Eröffnungfest del Festival Internacional de Música de Salzburgo, interpretando Clair, de Franco Donatoni. Asimismo, actúa ese mismo año en el “Taschenopern Festival” de Salzburgo, con Zahir Ensemble, grupo del que es miembro fundador. Con este grupo ha grabado para el sello Naxos obras de cámara de Schoenberg. Ha realizado también la primera grabación de “Inscriptio”, obra para clarinete solo de Sánchez-Verdú, para el sello Verso, muy elogiada por la crítica.
En 2007 es invitado a la primera edición del Festival Internacional de Música de Cámara Joaquín Turina, junto a artistas de la talla de Lluis Claret, Bengt Fosberg o el Kuss Quartet. Javier Trigos es profesor del Conservatorio Superior de Música Manuel Castillo de Sevilla.
Regularmente es invitado para ofrecer clases magistrales, cursos de verano así como conciertos. Recientemente ha sido invitado para formar parte del jurado del Concurso Internacional de Clarinete de Bérgamo, Italia.